En 2047, Nekki Basara décide de quitter la flotte de Macross 7 afin de voyager seul dans la galaxie. Durant son périple, il tombe sur la planète Zola en plein milieu d'une lutte entre la police et des braconniers de baleines galactiques. C'est aussi sur cette planète qu'il fait la connaissance de Elma, grande fan du groupe "Fire Bomber".