Un jour, après le passage d'un terrible typhon qui a frappé son quartier, Nobita se heurte à une étrange créature qui semble faite de vent. Celle-ci s'appelle Fuuko et va bien rapidement emmener le garçon et son ami Doraemon dans une quête pour sauver son village, une bourgade fantastique menacé par les tempêtes.