Bienvenue à la Nouvelle Domino City, une métropole tentaculaire et futuriste. L’opulence dont jouit la population lui a permis de s’adonner avec passion aux Turbo Duels, un nouveau type de duels de monstres. Cependant, en périphérie, se dresse Satellite, un bidonville à ciel ouvert, où résident les marginaux. Doté d’un talent inné pour la mécanique, Yusei Fudo, un duelliste hors pair, nourrit l’espoir de pénétrer au cœur de la capitale afin de renouer avec son ancien camarade, Jack Atlas.