Passionné depuis son plus jeune âge par le jeu « Duel Monsters », Jûdai Yûki intègre la Duel Académie, fondée par Seto Kaiba, espérant ainsi devenir le roi des duellistes. En dépit de son ingéniosité, il est contraint de rejoindre les Rouge Slifer, dont les résidents sont perçus comme étant les plus faibles du pensionnat. Pour autant, Jûdai ne se décourage pas et est fin prêt à montrer l’étendue de son talent, accompagné de ses nouveaux amis. Mais il se pourrait que leur quotidien paisible soit bouleversé par de nombreuses machinations…