Après avoir mis un terme aux villes manigances du vicieux Kyo, il est temps pour Naofumi, Raphtalia et leurs camarades de reprendre leur aventure là où elle avait été laissée. Naofumi, désormais vicomte suite à ses exploits face à Reiki, a pour projet de se réinvestir corps et âme dans la lutte face aux vagues. Toutefois, de nombreux nouveaux problèmes l’attendent, à commencer par l’éveil du Phœnix, une autre Bête Gardienne, provoqué par la disparition de la Tortue Spirituelle. Face à cette menace d’une tout autre ampleur, le monde à plus que jamais besoin du héros au bouclier ! Mais comme si cela n’était pas déjà suffisamment compliqué, les trois autres héros semblent avoir disparu suite à leur cuisant échec dans la bataille face à Reiki.