Utena perd ses parents alors qu'elle n'a que six ans. Un jour, errant tristement sous une pluie battante, elle tombe dans une rivière. Un homme mystérieux la sauve de la noyade. Il lui redonne de l'énergie et lui laisse une bague ornée d'un sceau en forme de rose. Sept ans plus tard, comme tous les ans depuis ce jour-là, Utena reçoit une lettre cachetée par le sceau de cette rose. Suivant les consignes de la lettre, elle s'inscrit à l'école Ohtori, ne sachant pas trop ce qui l'attend.