Avec l'apparition soudaine de monstres appelés "Dragons", le monde a connu de nombreux changements. En 25 ans, de nombreuses humaines sont nées avec des pouvoirs, les "D". Yuu Mononobe est le seul représentant masculin de cette nouvelle espèce humaine. Intégrant Midgar, une académie jusqu'alors exclusivement féminine, il va devoir apprendre à contrôler sa magie.