Dans un futur lointain, il est désormais possible de voyager dans le temps grâce à différentes machines. Ces bonds temporels, appelés "Time Bokan", sont notamment utilisés par les chercheurs pour découvrir la "Véritable Histoire", celle qui n'est pas dans les livres ou qui n'a pas été retranscrite correctement.

Calen est une jeune fille de 17 ans voyageant à travers les époques à la recherche de la vérité, mais aussi de ses parents disparus. Un jour, en tentant d'échapper à des membres de l'organisation Akudarma, elle rencontre Tokio, qui va devenir son partenaire et l'aider dans ses recherches.