Itoshiki Nozomu est un professeur particulièrement pessimiste dont même les kanji composant son nom forment le mot "désespoir" ! C'est en tentant de se suicider en se pendant à une branche de cerisier qu'il rencontre Kafuka Fûra, une lycéenne d'une naïveté incroyable. Exaspéré par cette fille au point de vue si différent du sien, Nozomu renonce pour un temps à se suicider mais il n'est pas au bout de ses surprises car c'est en classe qu'il retrouve Kafuka qui se révèle être une de ses élèves.

"Demain vous aurez un devoir sur table, mais ne vous inquiétez pas... Je n'attends rien de vous !"