Itoshiki Nozomu est un professeur particulièrement pessimiste dont même les kanji composant son nom forment le mot "désespoir" ! C'est en tentant de se suicider en se pendant à une branche de cerisier qu'il rencontre Kafuka Fûra, une lycéenne d'une naïveté incroyable. Exaspéré par cette fille au point de vue si différent du sien, Nozomu renonce pour un temps à se suicider mais il n'est pas au bout de ses surprises car c'est en classe qu'il retrouve Kafuka qui se révèle être une de ses élèves.