Dans un Japon en proie aux menaces extérieures, l’académie Buô forme les soldats de demain aux techniques de combat samouraï. À la demande de son amie d’enfance, Sen, Muneakira Yagyû, un maître du sabre venu y enseigner son art, découvre avec surprise que ses élèves sont exclusivement des jeunes filles. Si l’arrivée d’un homme suscite la crainte au sein de l’établissement et génère des dissensions parmi les membres du conseil, l’apparition soudaine de Jûbei sème davantage le trouble. En embrassant Muneakira, elle se révèle être la réincarnation d’un Master Samurai.