Tsukune Aono est un garçon, tout à fait banal, qui a raté tous les examens d'entrée au lycée. Par hasard, son père trouve une publicité pour le lycée Yokai, le lycée pour les monstres. C'est là-bas qu'il fait la rencontre de Moka Akashiya, une jeune fille à l'apparence angélique qui cache une double personnalité.