La série prend place dans l’univers des jeux vidéo Pokémon Écarlate et Pokémon Violet, et met en scène trois personnages originaux de la région de Paldea : Ohara, Arikis et Homa. Ils sont accompagnés des starters de la neuvième génération : Chochodile, Miascarade (forme évoluée de Poussacha) et Coiffeton. Tandis que tout semble les séparer, le trio doit collaborer pour mener à bien une mission pour le compte de leur académie.