Akira Nikaido est un lycéen qui menait une vie ordinaire jusqu'à sa rencontre avec Shirogane qui lui propose de devenir son ombre. Dans son incompréhension, le jeune homme refuse. Mais, lorsqu'il se fait attaqué en pleine nuit par deux créatures, l'inconnu réapparait. Akira doit à présent devenir un "shin", un être du monde de l'ombre, afin de rétablir l'équilibre.