Matoi Sumeragi est une collégienne âgée de 14 ans qui travaille à temps partiel en tant que miko au temple de Tenman Jinjya dans la ville de Kamaya.

Un jour, sa capacité de s'unir avec des dieux pour éloigner les mauvais esprits se réveille. Avec l'aide de sa meilleure amie, Yuma Kusanagi, une fille de kannushi, elle décide de purger sa ville des mauvais esprits afin de retrouver sa vie paisible.