En cherchant un trésor légendaire au fond de la mer de Hokkaido, Lupin, Jigen,Goemon et L'inspecteur Zenigata ont été propulsés 500 ans en arrière, à cause d'une machine à remonter le temps appartenant à un certain Kyosuke Mamô. Pour retourner à leur époque, ils n'ont que deux solutions : voler la machine ou percer le mystère du trésor...