Goemon Ishikawa XIII se marie à la mignonne Murasaki Inabe, la fille d'un grand chef de clan de samouraïs. Mais la fête est de courte durée puisqu'elle est très vite, elle est interrompue par les ninjas du clan Fuma qui kidnappent la mariée. Comme tout enlèvement, une rançon est demandée : les trésors de sa famille. Lupin, Jigen, Goemon et Fujiko vont encore travailler ensemble afin de sauver la jeune fille en détresse pour leur ami et, par la même occasion, subtiliser le trésor avant l'ennemi.