Mizuki est une officier des Forces japonaises d'autodéfense gravement blessée lors d'une bataille. Elle accepte d'être le premier prototype de l'Arme Ultime, un projet ayant pour but de concevoir une arme surpuissante pouvant protéger le Japon de tous ses ennemis.

De son côté, Chise souffre d'avoir été transformée en une arme contre son gré mais l'armée continue de l'envoyer aux combats.