Il y a trois cents ans, dans le pays glacial de la Sibérie, Jubei Yagyu s'était engagé dans une bataille féroce avec Kitaretsusai du clan Yagyu du Nord. Sa fille Freesia fut congelée dans la bataille.

Des années plus tard, suite au réchauffement climatique, Freesia se libère de sa tombe de glace et se rend au Japon en tant qu'étudiante où elle se lie d'amitié avec Jiyuu Nanohana. Cette dernière ne sait pas que la nouvelle élève l'a pour cible.