L'histoire se déroule dans un monde où l'Humanité a découvert un nouveau concept régissant tout ce qui est intangible (les émotions, la mémoire, etc...). Baptisé "Logic", ce concept gouverne tous les aspects de la vie, mais seuls quelques rares personnes, les Logicalist, sont capable de pleinement le maîtriser et d'en tirer parti.

L'académie Pirari est une école réputée située à Hokkaido, où sont formées de nombreuses étudiantes ayant le potentiel de devenir des Logicalists. Certaines élèves ont même déjà passé un contrat avec un Foreigner et y apprennent à maîtriser leurs pouvoirs. C'est notamment le cas de Liones Yelistratova, princesse d'un petit État, qui décide d'intégrer l'école malgré les réticences de son père.