Durant son enfance, Haruhi fut sauvée par un étrange garçon manipulant la magie. Rêvant de devenir magicienne, elle réussit à intégrer le cursus magique de son école ! Malheureusement, un incendie détruit sa salle de classe et elle n'a pas d'autre choix que de retourner en section régulière. Là-bas, elle croise un élève ressemblant étrangement à son sauveur.