Nous sommes en l'an 2041 et la Terre vit des jours heureux sans réel conflit. Pourtant, un homme mystérieux et richissime semble se douter de l'imminence d'un danger extra-terrestre et forme en secret une organisation capable de repousser l'envahisseur. Le jour même de l'arrivée de l'ennemi, Klein Sandman invite les principaux acteurs politiques et militaires (Earth Federation Alliance) de la Terre dans son gigantesque château afin leur montrer l'efficacité de son arme contre les aliens. Au même moment, un jeune homme nommé Eiji se faufile dans le château dans le but de retrouver sa soeur, dont il a perdu la trace il y a quelques temps et qui vient de lui envoyer un SOS par mail.