Cinq jeunes de la ville d'Edo découvrent en explorant une grotte un mystérieux robot. Créé par le docteur Hoarai, celui-ci a servi à défendre la Terre de l'attaque imminente d'étranges représentants d'une race inconnue située dans les souterrains. Si à l'époque les scientifiques s'étaient moqués des prédictions du scientifique, une telle menace existe bel et bien et semble sur le point de se réveiller... Youko et ses amis comprennent alors qu'ils vont devoir faire du Gowapper 5 leur arme pour se défendre.