Installé sur une Terre post-apocalyptique, Hayato Jin continue de diriger l'Institut de recherche Saotome.

Le pays d'Andromède, nouvel ennemi de l'humanité, cherche à détruire la source des rayons Getter qui ont dévasté sa civilisation. L'espoir repose désormais sur le robot Getter Robo Ark, mais l'apparition d'un autre mystérieux robot, piloté par le fils de Ryoma Nagare rend la situation encore plus compliquée...