600 ans après Ginga Senpuu Braiger, Jupiter a été détruite. De nouvelles planètes ont vu le jour dans le système solaire, entraînant davantage de colons à travers la galaxie. Pour contrer l'anarchie qui se prépare, Don Diego Condor fait appel à Billy the Shot, Samanosuke Dodi, Layla Minesato et Shuteken Radcliffe, quatre pilotes d'élite qui vont s'efforcer de faire régner l'ordre.