En l'an 2031, les hommes jouissent d'une existence prospère jusqu'à ce que des formes de vie étranges appelées Hadeans apparaissent. Afin de contrer cette menace, l'humanité organisa la Neo International Defense Force. Shu Aiba, ancien pilote de chasse, s'engage dans la lutte tandis que Rurika Yuno, l'une de meilleures scientifiques, enquête sur les créatures. Un jour, elle entend du "Livre des morts". Quel est le secret de ce ouvrage ? Quel est son lien avec les créatures ?