Un jour, à Kobe, Juna et son ami Tokio décident d'aller voir la mer du Japon. Malheureusement, au cours du trajet à moto, la lycéenne meurt dans un terrible accident.

Alors qu'elle s'élève vers l'au-delà, elle a une vision de la Terre dévorée par d'énormes vers rouges. Soudain, elle entend une voix étrange qui lui explique que ces monstres sont des Rajaa, les maux de la Terre, et que sa vision se réalisera si personne n'y prend garde. Il lui propose alors de la ressusciter à condition qu'elle devienne l’avatar du temps, une entité vivante, qui ne faisant qu'un avec la Terre, est capable de prévenir les attaques des Rajaa.