Quand le père de Nobita lui achète un grand scarabée rhinocéros, le jeune garçon promet d'en prendre soin.

Plus tard, accompagné de Doraemon et de ses amis, il découvre une île étrange où une tribu coexiste avec des créatures préhistoriques. Longtemps considérées comme disparues, celles-ci sont préservées par l'esprit mythique d'un scarabée nommé Golden Hercules. Malheureusement des individus venus du futur souhaite s'emparer de l'insecte afin d'en tirer profit.