Un jour, Nobita trouve un jeune arbre dans les collines, et décide de le ramener chez lui. Malheureusement, sa maman refuse qu'il soit planté dans son jardin. Doraemon sort alors de sa poche un élixir permettant à l'arbuste de se déplacé. Les trois compagnons vont ainsi partir à l'aventure sur une planète où la nature est en voie de destruction...