Tomoo Kinoshita est un élève de CM1 vivant dans le complexe résidentiel d'Edajima avec sa mère, son père et sa soeur. Bien qu'étant rempli de gags plutôt surréalistes, "Danchi Tomoo" montre aussi les émotions et péripéties de la famille Kinoshita ainsi que celles de leur amis et voisins.