Japon, 2016. Une catastrophe nucléaire survient à la centrale d'Odaiba, tout près de Tokyo. Le gouvernement fait évacuer la capitale, qui devient une ville fantôme. Vingt ans plus tard, alors que les retombées radioactives sont toujours trop élevées pour permettre aux humains de s'aventurer sur place, les forces japonaises d'auto-défense envoient trois lycéennes à la recherche d'éventuels survivants. Pas de protection, pas d'équipement particulier : les adolescentes sont génétiquement modifiées pour résister aux radiations...