Il y fort longtemps la guerre entre les forces de la Lumière et des Ténèbres faisait rage. Chaque belligérant possédait de grands pouvoirs mais le plus illustre était nommé le pouvoir de l'Ombre. Grâce à leur courage et leur puissance, les 7 chevaliers de la Lumière anéantirent les forces des Ténèbres et scellèrent le pouvoir de l'ombre à tout jamais. Cependant, caché de la conscience des êtres humains, le pouvoir de l'Ombre survécut année après année, génération après génération...
Aujourd'hui il resurgit. Le cruel Nene souverain du royaume de Guran, aspire à conquérir le monde grâce à la combinaison de pouvoir de l'Ombre et de la puissance des machines. Dans leur quête pour contrer ce plan démoniaque, Zola et Jiro vont joindre leur forces afin de retrouver les descendants des 7 chevalier de la Lumière. Peu de temps après leur arrivée dans le village paisible de Talta, ils sont pris à partie par l'armé de Nene. Les jeune Shu et Kluke se retrouvent coincés au milieu de la bataille. alors qu'il est sur le point de perdre tout ceux qu'il aime, Shu réveille le légendaire BLUE DRAGON, une Ombre. Mais parviendra t-il avec l'aide de ses nouveaux amis à arrêter Nene et sauver le monde de la menace des forces des Ténèbres ?