Dans les années 1990, à Kushiro, sur l'île d'Hokkaido, trois Dragonites apparaissent en détruisant tout sur leur passage. Dans leur fureur, ils réveillent Jashin Drago, un terrible magicien qui, il y a 200 ans, avait été vaincu par un valeureux guerrier et emprisonné par un sceau sacré. Libéré de toute entrave, le sorcier décide de reprendre sa conquête du monde. Hélas, il est loin de se douter qu'un jeune homme de 16 ans, Ken Taiga, descendant de son ennemi, est prêt à se dresser sur sa route.