Dans l'au-delà existe un immense campus, où sont envoyés les adolescents après leur décès. C'est là que se réveille Yuzuru Otonashi. Mais n'ayant pas le temps de comprendre ce qui lui arrive, il est subitement pris dans un feu croisé entre les membres de Tenshi et la Shinda Sekai Sensen. Yuri Nakamura, leader du SSS, lui explique la raison de leur rebellion contre Dieu.