L'histoire se déroule dans un monde où se mêle pouvoir surnaturel et magie.
Dans la cité académique comptant pas moins de 2,3 millions d'habitants, 80% sont des étudiants travaillent pour un programme de développement du cerveau humain.

Mikoto Misaka est une étudiante de la Cité Scolaire qui a la capacité de générer et de contrôler l'électricité. Sa puissance et sa maîtrise la classent au niveau 5, le plus haut niveau de puissance connu.

Principale animation de l'année, le festival Daihasei regroupe pendant sept jours des épreuves d'athlétisme.