Dans un futur lointain, le monde est déchiré en deux blocs : l'Est et l'Ouest qui connaissent une paix bien précaire tandis que l'ombre de la guerre se rapproche. C'est dans ce contexte tendu que Mylenne Hauffman, l'agent secret du bloc Ouest désignée par le matricule 009-1, a pour mission de récuper le  docteur Soyuzu retenu captif dans l'ennemi.

Celui-ci aurait découvert une nouvelle source d'énergie révolutionnaire qui, utilisée par des personnes mal intentionnées, pourrait être à l'origine d'une arme plus dévastatrice que la bombe nucléaire.

Alors qu'un traité de désarmement nucléaire est sur le point d'être ratifié, ces recherches mettent la paix en péril. La mission de 009-1 ne doit en aucun cas se solder par un échec.